Respecto al tubo no sé, el mío es un 10P y no lo lleva, pero diría que, a no ser que lo hicieras tu mismo, te cambiaron el regulador pero no te cambiaron el tubo. El tubo tiene gracia quitarlo de la parte delantera de la culata y si el mecánico lo vio bien seguramente pensó que para que complicarse la vida.
Respecto a la egr solo te puedo decir una cosa...¿aún la llevas activa? quítala ya hombre!! Si no la quieres quitar mira si está muy sucia u obstruida y una vez que veas que está en condiciones quítale el tubo de vacío, verás menos humo y el motor te lo agradecerá.

Si me a dicho el mecánico que es jodido la parte que enrosca al bloque..., Sino se lo cambiaría yo.
Respecto a la EGR segurísimo está muy sucia pero no me atrevo a quitarla por la ITV e visto kit sustitutos de la EGR, que creo que eso sería la anulación, si tenéis algún archivo que explique cómo se limpia y también como se sustituye lo agradecería mucho. Se que es el EGR pero no sé cuál es el tubo de vacío y demás.

El tubo de retorno que viene con los reguladores de recambio paralelo es de una calidad penosa.
Casi todos, al poco tiempo, y por efecto del propio calor, empiezan a perder en el engatillado de la parte metálica con el flexible.
Prefiero dejar el "viejo" original a poner el "nuevo" paralelo.
Con eso te digo todo, si es el caso.
Sobre el humo negro, comprueba la cantidad de aire que aspiras con el valor del MAF y la presión del turbo a la que llegas y que rpm.

Pues seguro que es el que venía con el kit.., el tubo en si se ve nuevo pero exactamente como dices estando tan cerca motor se "pique" a mi seme a roto cerca del engatillado del regulador, nose si ponerle cuando se cambie a todo su alrededor algún tipo de aislamiento térmico.
Respecto a las mediciones nose si necesitare nanocom o otra diagnosis podría darme esos valores, limpiare EGR y demás e iré contando gracias amigos.